雖然大家都說seo優化好，實際上缺點有下列這些：
SEO優化的缺點1_SEO優化的時間長
對於需要大大改善、SEO優化的公司來說，進行最佳化的設計是要花3個月到半年以上的改善時間，而若再加上競爭非常激烈的關鍵字，可能要進行一年或者更長時間的優化，而優化的長短可能還會因為一些不確定的因素來影響，例如:系統出問題、找不出原因改善關鍵字等等。
SEO優化的缺點2_無法控制曝光度
雖然經過SEO優化後，搜尋者可以透過關鍵字正確搜尋到，但可能因為大量的曝光，以致於吸引了想了解、能獲此獲得利益的消費者，但也容易吸引想了解、但不想花費的瀏覽者，雖然曝量量大增，卻增加管理者的負擔，若無法解決他們提出的問題，容易造成SEO優化失敗。
SEO優化的缺點3_演算法與SEO的長期戰
由於搜尋引擎會不定期的更改演算法，因此網站也要立馬更改為貼切新演算法的模式，這樣一來只是SEO與演算法打更長期的戰爭，而還處於被動迎擊狀態，雖然更改的項目可能不多，但就是要密切的觀察，雖然這樣對搜尋者來說才能帶來好的使用者體驗，但卻也造成另一種花費。
